Leider unterstützen zur Zeit Browser nur die ersten beiden Kanäle einer Soundkarte. Wenn Du dein Mikrofon bei einer Soundkarte mit vielen Kanälen auf einen anderen Kanal gelegt hast, wird WebRTC nicht klappen.
Unter Windows gibt es allerdings einen Trick. Man kann eine sogenannte virtuelle Soundkarte installieren. Dazu gibt es eine passende Software namens Virtual Audio Cable. Mit ihr können aus bestehenden Soundkarte (deine Soundkarte mit den vielen Kanälen) eine virtuelle Stereo-Soundkarte erstellt werden, mit der auch der Browser umgehen kann.